與白色彗星帝國作戰(zhàn)三年后——為了拯救瀕臨滅亡的加米拉斯民族,戴斯拉總統(tǒng)繼續(xù)探索新的母星,最終在銀河的一處找到了符合條件的行星。但是,那里是強(qiáng)大的星際國家的領(lǐng)土范圍內(nèi)。在銀河中爆發(fā)的領(lǐng)土紛爭,導(dǎo)致與加米拉斯締結(jié)安全保障條約的地球被無情地卷入到了其中。給地球帶來軍事、經(jīng)濟(jì)優(yōu)越性的時間斷層技術(shù),以自己的生命為代價而消失了——雖然被自責(zé)的念頭驅(qū)使著,但依舊擔(dān)任著大和號新艦長的古代進(jìn),為了應(yīng)對即將到來的事件,和新船員們一起開始了航海訓(xùn)練。卻也不知道其中混進(jìn)了什么人在盯著自己。盡管如此還是要“活下去”?在從未有過的不安時代,大和號迎來了新的旅程。在那前方,有著超乎想象的新敵人在等待著他們……