西元1999年,一顆不明的巨大「流星」墜落在地球上。之後調(diào)查證實(shí)這其實(shí)是一艘外星人的宇宙船,之後世界的某些強(qiáng)國為了將其修復(fù)並彌補(bǔ)墜落時(shí)對(duì)地球環(huán)境所造成的破壞(還得掩蓋掉這個(gè)外星船墜落的事實(shí)),而組成了統(tǒng)合政府。並由地球統(tǒng)合軍將其改造成為全長1200公尺的超大型主力戰(zhàn)艦,命名為「馬克羅斯」(MACROSS,德文「大宇宙」之意)。其間人類卻也歷經(jīng)統(tǒng)合派與反統(tǒng)合派國家陣營的分裂,在綿延的爭戰(zhàn)中馬克羅斯的改修則仍然持續(xù)著。直到10年後,在馬克羅斯舉行正式起用下水典禮的當(dāng)天,在月球軌道附近突然發(fā)現(xiàn)有大規(guī)模的時(shí)空跳躍反應(yīng)。而此時(shí)馬客羅斯艦上的主炮竟自動(dòng)發(fā)射,並擊中在月球出現(xiàn)的外星艦隊(duì)觀測(cè)艦!事已至如此頓時(shí)成了趕鴨子上架,不把對(duì)方惹毛才是怪事……於是統(tǒng)合軍只好展開接戰(zhàn),並讓馬克羅斯升空啟航,以轉(zhuǎn)移敵方注意。青年一條輝陰錯(cuò)陽差的坐上了統(tǒng)合軍的戰(zhàn)機(jī)捲入戰(zhàn)鬥,並救起了一位名叫林明美的少女,且與艦上女軍官早賴未沙的不吵不相識(shí)……被稱為「第一次宇宙大戰(zhàn)」的這場人類對(duì)異星人的戰(zhàn)爭就此揭開了序幕。而圍繞在輝、明美與未沙之間的感情糾葛,卻也開始介入了戰(zhàn)事的發(fā)展之中,甚而成為主導(dǎo)後來歷史走向的契機(jī)……